CISH / FISH

Die In-situ-Hybridisierung (ISH) ist eine Methode zum Nachweis von spezifischen DNA- und RNA-Sequenzen direkt auf dem histologischen Schnittpräparat (in situ).

Die nachzuweisenden Sequenzen können virale RNA oder DNA sein oder auch Translokationen, Deletionen und Amplifikationen von humanen Genen beinhalten. Spezifische Sonden (= komplementäre DNA-Abschnitte) werden an die gesuchten Sequenzen gebunden und mit Hilfe diverser Färbemethoden im Zellkern sichtbar gemacht.

Chromogene Färbungen (CISH) werden bei uns für den Nachweis viraler RNA sowie von Genamplifikation verwendet, während Fluoreszenzfarbstoffe (FISH) derzeit hauptsächlich zur Detektion von Translokationen und Deletionen dienen.

Die Stärke der Methode liegt darin, dass sie es möglich macht, eine bestimmte genetische Aberration direkt der betroffenen Zelle zuzuordnen. Dadurch ist es möglich, z.B. bei Genamplifikation, einen Unterschied zwischen Tumor- und Normalgewebe zu detektieren.

fish

Methoden

CISH

EBER, HER2, EGFR

NHL

ALK Translokation
IgH-BCL2 t(14;18)(q32;q21)
BCL2 Translokation
IgH Translokation
IgH-CCND1 t(11;14)(q13;q32)
CCND1 Translokation
PAX5
MALT1
BCL6 Translokation
MYC Translokation

B-CLL

del17q (TP53)
del11q
del13q
Trisomie 12
del6q23 (c-myb)
IgH-BCL3 t(14;19)(q32;q13)

T-PLL

TCR alpha/delta (inv14)

Akute Leukämien

BCR-ABL
MYC Translokation
CBFB (inv16)
PML-RARa t(15;17)(q22;q12)
RARA-Translokation

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